制药工程学院培养具备制药工程、中药制药、生物制药、化学制药、及药物制剂、药品与食品安全等方面基本理论知识、实验技能和工程实践能力，能在制药、生物化工、保健食品、化妆品等行业从事产品的研制开发、生产以及应用研究和经营管理的高级工程技术人才。
学院设置制药科学教研室和制药工程教研室，药学基础实验教学中心、制药工程
本科实验室、制药工艺本科实验室、民族药及药食同源产品工程实训中心、生物制药工程实训中心、GMP工程中心、制药新材料及技术协同创新中心、制药共性技术工程中心等，满足本科理论教学、实验教学、实训及实践教学的需要。
制药工程学院将引进现代工程教育理念,学生在制药工程基础知识、个人能力及人际团队能力和制药工程系统能力四个层面得到学习与锻炼，使学生形成终身学习的习惯，培养学生系统工程技术能力，尤其是项目的构思、设计、开发和实施能力。
学院是“2011计划”省级特色功能材料协同创新中心的重要组成部分，同时学院联合制药企业建立校外基地，广泛拓展产学研一体化领域。
制药工程专业
培养目标：本专业培养具有制药工程专业知识和从事药品、药用辅料、医药中间体以及其他相关产品的技术开发、工程设计和药品质量管理等方面的能力，具有良好的职业道德、高度的社会责任感、较强的产品质量意识和一定的团队合作能力。适应制药工业发展和制药现代化建设需要的制药工程高级专业技术人才。
主要课程:有机化学、物理化学、工程制图、制药工程原理、药物化学、制药工艺学和制药设备与车间设计等课程。
就业方向：可在制药及其相关领域的生产企业、科研院所、设计院和监管部门等单位和行政部门从事产品开发、工程设计、生产管理和科技服务等专业技术和管理工作。
学制：四年 授予学位：工学学士
制药工程专业（食品与药品安全方向）
培养目标：培养具有制药工程专业知识和从事药品、药用辅料、医药中间体以及其他相关产品的质量监控、环境安全、质量管理和现代化制剂技术等方面的能力，适应制药工程现代化建设需要的药品食品安全工程高级专业技术人才。
主要课程：有机化学、分析化学、工程制图、制药工程原理、生物化学、药学微生物基础技术、药物化学、药物制剂、现代药物分析检验技术、药品生物检定技术、药物质量管理规范、现代仪器分析技术、制药设备与车间设施规划等课程。
就业方向：可在药品食品质量监测、职业卫生监管构、生产企业、科研院所等单位和行政部门从事药品生产、经营企业、药品监督管理、药品开发、生产、贮藏、销售、使用过程中质量检测和质量管理等工作。
学制：4年 授予学位：工学学士
制药工程专业（民族制药方向）
培养目标：培养具有制药工程专业知识和从事中药、民族药、药用辅料、医药中间体以及其他天然资源相关产品的现代化工程技术开发、工程设计和药品质量管理等方面的能力，适应民族制药工业发展和中药、民族药现代化建设需要的高级工程专业技术人才。
主要课程：有机化学、工程制图、制药工程原理、天然药物化学、药物制剂、中药制药工艺学、天然保健品工艺学及制药设备与车间设计等课程。
就业方向：可在民族制药及天然资源保健品、药用化妆品等生产企业、科研院所、设计院和监管部门等单位和行政部门从事产品开发、工程设计、生产管理和科技服务等专业技术和管理工作。
学制：4年 授予学位：工学学士
制药工程专业（职教师资方向）
培养目标：培养具有制药职教师资的教学能力，既具备制药工程专业知识和从事药品、药用辅料、医药中间体以及其他相关产品的技术开发、工程设计和药品质量管理等方面的能力，又适应制药工业发展和制药现代化建设需要的职业教育师资人才和高级工程专业复合型人才。
主要课程：有机化学、物理化学、工程制图、化工原理、药物化学、制药工艺学和制药设备与车间设计、教育学、教育心理学等课程。
就业方向：既可在制药及其相关领域的生产企业、科研院所、监管部门等单位和行政部门等从事产品开发、工程设计、生产管理、科技服务等专业技术和管理工作，又可以从事制药职业教育和相关职业教育工作。
学制：4年 授予学位：工学（或教育学）学士
